"Dị Thứ Nguyên Thể" bắt đầu gây chiến tranh với loài người. Để chống lại nỗi hiểm họa này, học viện Genetics được thành lập để huấn luyện chiến binh có thể sử dụng vũ khí và giáp chiến đặc biệt. Kazuya Aoi quyết định nhập học trường vì lời hứa với chị gái cậu, một chiến binh đã hi sinh trong trận chiến. Ở đây cậu gặp Satellizer El Bridgette, biệt danh "Nữ Hoàng Nghiêm Cấm Tiếp Cận" vì tính tình cách ly lập dị và cũng vì là là học sinh cấp cao học viện, có thành tích bất bại trong giả lập thực chiến... cho tới khi gặp được Aoi.